アジトはいわゆる「ホーム」画面になります。
ここを起点に、様々なクエストに挑戦しにいくことができます。
アジトに表示されているキャラクターを長押しすることで、所持している別キャラクターに変更することができます。
ただし配置箇所ごとに担当できるキャラクターが制限されており、リストに表示されるキャラクターしか選択することができません。
おおよそ中央に配置できるキャラがもっとも身長が高いグループで、そこから端に行くにつれて身長が低くなっていくという法則になっているようです。
それぞれ以下のページで詳しく解説しています。